More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1422 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1422  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  618  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000419249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  44.34 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  45.9 
 
 
296 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.01 
 
 
297 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.95 
 
 
302 aa  235  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  46.93 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  45.63 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  43.69 
 
 
297 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  44.34 
 
 
297 aa  225  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  38.95 
 
 
386 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  40.62 
 
 
307 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.97 
 
 
334 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.54 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.45 
 
 
289 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.27 
 
 
317 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.82 
 
 
324 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  40.51 
 
 
301 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  40.37 
 
 
331 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.81 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  39.81 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.17 
 
 
341 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  36.17 
 
 
313 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  34.19 
 
 
373 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  39.47 
 
 
297 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  37.76 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  38.06 
 
 
376 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  38.06 
 
 
376 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  36.91 
 
 
299 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  38.06 
 
 
376 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  38.37 
 
 
316 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  37.78 
 
 
376 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  37.78 
 
 
376 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  37.78 
 
 
376 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  37.78 
 
 
376 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  37.78 
 
 
376 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.87 
 
 
315 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
380 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
376 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1968  chaperone protein DnaJ  34.89 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00646622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  33.81 
 
 
375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.31 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.66 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  36.18 
 
 
378 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  39.56 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  35.43 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.28 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  40.88 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.76 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  33.7 
 
 
376 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  38.99 
 
 
319 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  33.97 
 
 
311 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.31 
 
 
320 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  33.8 
 
 
381 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  34.66 
 
 
299 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.01 
 
 
339 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  33.81 
 
 
367 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.64 
 
 
351 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
297 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  36.75 
 
 
335 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  32.8 
 
 
377 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  33.71 
 
 
375 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  36.75 
 
 
335 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.37 
 
 
291 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.32 
 
 
314 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  32.69 
 
 
374 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  35.83 
 
 
313 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  32.96 
 
 
378 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  33.06 
 
 
381 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  30.81 
 
 
381 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  34.76 
 
 
374 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  32.69 
 
 
385 aa  166  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.5 
 
 
324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  32.53 
 
 
377 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  32.21 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  32.21 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  32.14 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  32.77 
 
 
370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  34.73 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  38.39 
 
 
309 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  36.88 
 
 
304 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  36.5 
 
 
340 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  33.68 
 
 
373 aa  165  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  36.76 
 
 
318 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.58 
 
 
318 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.77 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  38.24 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  34.38 
 
 
377 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3070  chaperone DnaJ domain protein  38.68 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  31.87 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  35.83 
 
 
334 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  35.54 
 
 
320 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  33.52 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  33.99 
 
 
376 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  31.62 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  33.89 
 
 
372 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  37.19 
 
 
318 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  32.39 
 
 
374 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  31.59 
 
 
382 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  36.23 
 
 
335 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>