More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3803 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  58.31 
 
 
299 aa  341  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  54.7 
 
 
301 aa  338  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  57.89 
 
 
309 aa  317  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  60.6 
 
 
306 aa  311  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  59.59 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  54.72 
 
 
303 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.59 
 
 
315 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.31 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.03 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.72 
 
 
287 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.77 
 
 
311 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.67 
 
 
289 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.81 
 
 
315 aa  205  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.28 
 
 
334 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.17 
 
 
341 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.17 
 
 
313 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.27 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  36.25 
 
 
302 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  34.53 
 
 
330 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  37.94 
 
 
307 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  37.46 
 
 
313 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  38.61 
 
 
294 aa  191  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.03 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  40 
 
 
318 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  39.66 
 
 
318 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
320 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.93 
 
 
283 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  35.96 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  34.07 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  39.31 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.15 
 
 
330 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.7 
 
 
324 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  34.56 
 
 
335 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  34.62 
 
 
315 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.18 
 
 
317 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  40.13 
 
 
314 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.55 
 
 
315 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  36.16 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  32.9 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  36.77 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  35.6 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  37.24 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  36.86 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  32.58 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  35.29 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  38.11 
 
 
312 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.11 
 
 
325 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.91 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  30.33 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.79 
 
 
324 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  31.52 
 
 
333 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  34.6 
 
 
324 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.9 
 
 
308 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  32.37 
 
 
320 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  36.84 
 
 
326 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  36.57 
 
 
311 aa  168  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.38 
 
 
319 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  37.38 
 
 
319 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.06 
 
 
319 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.18 
 
 
306 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  33.02 
 
 
326 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  34.85 
 
 
306 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.92 
 
 
351 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  38.31 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.29 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.29 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.29 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.29 
 
 
306 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.29 
 
 
306 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  32.61 
 
 
327 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  34.45 
 
 
290 aa  165  9e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  36.45 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  33.77 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  34.97 
 
 
306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.48 
 
 
313 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.11 
 
 
392 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0351  chaperone DnaJ domain protein  34.06 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.697421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  36.42 
 
 
314 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  36.75 
 
 
314 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  32.21 
 
 
314 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  34.37 
 
 
331 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  32.13 
 
 
378 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  30.77 
 
 
372 aa  160  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  36.24 
 
 
304 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  35.5 
 
 
319 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  32.09 
 
 
297 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.11 
 
 
316 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  33.89 
 
 
297 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  33.74 
 
 
335 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  35.33 
 
 
297 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  33.74 
 
 
335 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  31.06 
 
 
333 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.85 
 
 
325 aa  158  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>