More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5306 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  58.11 
 
 
336 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  57.68 
 
 
301 aa  318  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  52.72 
 
 
303 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.52 
 
 
392 aa  298  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  51.85 
 
 
304 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  51.52 
 
 
304 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1264  heat shock protein DnaJ domain protein  52.2 
 
 
307 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0110281  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  47.74 
 
 
333 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  47.23 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0507  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.49 
 
 
304 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.830824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.79 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2992  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.13 
 
 
306 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.7 
 
 
320 aa  225  6e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.69 
 
 
313 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.94 
 
 
323 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1086  chaperone DnaJ domain protein  38.94 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0655  chaperone DnaJ-like protein  41.67 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.610813  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5524  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.72 
 
 
308 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.3 
 
 
317 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  41.14 
 
 
297 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.99 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0404  heat shock protein DnaJ-like protein  42.44 
 
 
310 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.203167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  38.18 
 
 
339 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0726  heat shock protein DnaJ-like  38.51 
 
 
302 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.749707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1138  chaperone DnaJ-like  37.54 
 
 
325 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2465  putative heat shock (dnaJ-kile)  39.94 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.89 
 
 
335 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1070  heat shock protein DnaJ domain protein  39.37 
 
 
310 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  37.89 
 
 
323 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  39.25 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_004310  BR0418  chaperone protein DnaJ, putative  37.38 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0426  putative chaperone protein DnaJ  37.38 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  38.54 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  35.58 
 
 
340 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.81 
 
 
324 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2102  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
312 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0238412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  36.56 
 
 
333 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.76 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0767  chaperone DnaJ-like  36.14 
 
 
319 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.937963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  38.44 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.63 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.18 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  37.38 
 
 
326 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.09 
 
 
334 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.61 
 
 
294 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1309  chaperone DnaJ-like  38.01 
 
 
323 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  35.28 
 
 
333 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  35.29 
 
 
335 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.01 
 
 
341 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  36.93 
 
 
313 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.23 
 
 
311 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  35.29 
 
 
335 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  34.44 
 
 
333 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  36.7 
 
 
294 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0395  DnaJ family protein  38.46 
 
 
299 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.460833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  36.42 
 
 
324 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  35.14 
 
 
299 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.57 
 
 
334 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  34.78 
 
 
330 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  33.23 
 
 
333 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.44 
 
 
324 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  36.96 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.84 
 
 
283 aa  165  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  37.54 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.55 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  34.95 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  33.67 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.06 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  38.23 
 
 
297 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.03 
 
 
335 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  37.23 
 
 
330 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.73 
 
 
330 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.07 
 
 
324 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.36 
 
 
315 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  37.33 
 
 
313 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0534  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.6 
 
 
318 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  38.62 
 
 
299 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  37.88 
 
 
297 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.53 
 
 
313 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.29 
 
 
315 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  37.74 
 
 
330 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  38.39 
 
 
328 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  34.95 
 
 
318 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  37.03 
 
 
315 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  37.25 
 
 
302 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  41.61 
 
 
311 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.74 
 
 
318 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  37.74 
 
 
318 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  37.21 
 
 
331 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.49 
 
 
317 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  38.85 
 
 
298 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  35.48 
 
 
319 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  35.12 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4293  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.1 
 
 
316 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36.98 
 
 
325 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.42 
 
 
318 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.33 
 
 
287 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4662  heat shock protein DnaJ domain protein  38.78 
 
 
316 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.201642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>