More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3374 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  59.2 
 
 
318 aa  324  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  51.99 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  49.08 
 
 
315 aa  298  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  51.51 
 
 
321 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  48.19 
 
 
313 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  49.08 
 
 
315 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  46.5 
 
 
327 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  45.43 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  45.43 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  49.4 
 
 
320 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.11 
 
 
325 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  50.9 
 
 
331 aa  272  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  47.24 
 
 
326 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  48.12 
 
 
313 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.9 
 
 
331 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.02 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.24 
 
 
313 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.46 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  44.68 
 
 
326 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.29 
 
 
326 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.71 
 
 
324 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.11 
 
 
331 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.29 
 
 
319 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  43.2 
 
 
313 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.49 
 
 
324 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  43.93 
 
 
304 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  43.08 
 
 
295 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.27 
 
 
313 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.39 
 
 
317 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  42.51 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  42.51 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  40.95 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  39.51 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  39.51 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  39.51 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  39.51 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  39.82 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  39.51 
 
 
306 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  39.51 
 
 
306 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  39.21 
 
 
306 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  39.21 
 
 
306 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  37.9 
 
 
324 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  42.51 
 
 
319 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  41.25 
 
 
316 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.51 
 
 
319 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  40.99 
 
 
297 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  41.02 
 
 
313 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  38.86 
 
 
306 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  38.86 
 
 
306 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  38.86 
 
 
306 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  38.86 
 
 
306 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  38.86 
 
 
306 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  41.47 
 
 
315 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.3 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  36.09 
 
 
330 aa  200  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  40.24 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  38.3 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.79 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  38.1 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  38.48 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  37.99 
 
 
296 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.84 
 
 
318 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  38.51 
 
 
314 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  34.67 
 
 
307 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.35 
 
 
323 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  38.25 
 
 
320 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.93 
 
 
325 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  39.23 
 
 
324 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  39.82 
 
 
309 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  40 
 
 
304 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  38.51 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  43.54 
 
 
318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0039  heat shock protein DnaJ  35.99 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  34.46 
 
 
335 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  35.06 
 
 
333 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.26 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.76 
 
 
326 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  39.88 
 
 
299 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  35.53 
 
 
287 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.36 
 
 
316 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  35.38 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.36 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  39.94 
 
 
293 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.88 
 
 
293 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.55 
 
 
351 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  32.56 
 
 
335 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  32.56 
 
 
335 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.14 
 
 
334 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  33.72 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  39.5 
 
 
337 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
340 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  36 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3589  heat shock protein DnaJ domain protein  39.82 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0561803  normal  0.0551979 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  30.54 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  32.86 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  32.34 
 
 
386 aa  162  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.42 
 
 
287 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.67 
 
 
311 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  31.37 
 
 
382 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>