More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2700 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  53.65 
 
 
315 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  52.32 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  51.41 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  51.41 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  52.22 
 
 
315 aa  309  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.04 
 
 
323 aa  308  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  50 
 
 
313 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  55.1 
 
 
308 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.15 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  53.04 
 
 
313 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  50.31 
 
 
326 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.8 
 
 
324 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.48 
 
 
313 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.96 
 
 
315 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.53 
 
 
324 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  54.26 
 
 
304 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.47 
 
 
313 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  46.25 
 
 
324 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  49.53 
 
 
321 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  49.7 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.04 
 
 
317 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  47.27 
 
 
313 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  50.47 
 
 
319 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  50.48 
 
 
314 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.53 
 
 
326 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  46.58 
 
 
320 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  46.3 
 
 
330 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  46.91 
 
 
326 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  49.52 
 
 
314 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  49.84 
 
 
315 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  50.63 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  47.44 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  47.44 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  47.44 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  47.44 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  47.44 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  46.35 
 
 
313 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  45.4 
 
 
314 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.14 
 
 
316 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  47.25 
 
 
295 aa  248  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  45.86 
 
 
306 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  45.86 
 
 
306 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  45.86 
 
 
306 aa  246  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  45.86 
 
 
306 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  45.86 
 
 
306 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  45.86 
 
 
306 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  45.86 
 
 
306 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  46.3 
 
 
304 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  45.86 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.34 
 
 
319 aa  245  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  50.16 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  45.54 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.8 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  44.24 
 
 
320 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  49.37 
 
 
319 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.53 
 
 
319 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  44.31 
 
 
337 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  46.15 
 
 
309 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  47.04 
 
 
319 aa  235  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  44.69 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.25 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  44.69 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  48.26 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  41.81 
 
 
335 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  41.64 
 
 
307 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.89 
 
 
318 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  45.45 
 
 
331 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  46.46 
 
 
318 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  43.67 
 
 
297 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.15 
 
 
331 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 
324 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.86 
 
 
351 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.55 
 
 
347 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  44.97 
 
 
340 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.65 
 
 
289 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  41.82 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.16 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 
315 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  37.99 
 
 
330 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.51 
 
 
287 aa  208  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.72 
 
 
335 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.33 
 
 
316 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  39.46 
 
 
311 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  33.98 
 
 
373 aa  205  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  38.07 
 
 
333 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  39.38 
 
 
326 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  36.39 
 
 
301 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.95 
 
 
291 aa  202  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.53 
 
 
324 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1364  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.42 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1433  DnaJ protein  41.42 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  36.69 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.36 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.04 
 
 
287 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  41.77 
 
 
318 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02638  curved DNA binding protein  42.22 
 
 
299 aa  198  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  41.75 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.76 
 
 
325 aa  195  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>