More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2053 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
378 aa  767    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2059  chaperone protein DnaJ  70.98 
 
 
376 aa  520  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1249  chaperone protein DnaJ  67.1 
 
 
380 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38744  normal  0.199724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  56.03 
 
 
375 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  55.53 
 
 
374 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 
375 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  55.5 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  55.04 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  55.43 
 
 
379 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0390  chaperone protein DnaJ  55.98 
 
 
386 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  52.39 
 
 
372 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  54.76 
 
 
377 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  56.91 
 
 
376 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 
378 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0337  chaperone protein DnaJ  55.04 
 
 
379 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3920  chaperone protein DnaJ  53.21 
 
 
380 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  54.76 
 
 
377 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  54.55 
 
 
379 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  52.79 
 
 
383 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  56.12 
 
 
375 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  51.98 
 
 
385 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  53.62 
 
 
377 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2042  chaperone protein DnaJ  54.5 
 
 
377 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  51.72 
 
 
385 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  54.86 
 
 
388 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
382 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  51.46 
 
 
381 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  54.26 
 
 
385 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  53.66 
 
 
387 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  51.97 
 
 
382 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  52.23 
 
 
382 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  52.52 
 
 
388 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  51.58 
 
 
376 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  51.45 
 
 
378 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  53.03 
 
 
377 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  51.45 
 
 
378 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  51.58 
 
 
376 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  52.77 
 
 
377 aa  375  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  51.58 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  51.58 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
376 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  52.23 
 
 
382 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  51.58 
 
 
376 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  51.58 
 
 
376 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  51.58 
 
 
376 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  51.32 
 
 
379 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  51.58 
 
 
376 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  50.92 
 
 
375 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  51.69 
 
 
382 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  51.18 
 
 
382 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  54.05 
 
 
395 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  51.19 
 
 
378 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  53.17 
 
 
382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
379 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
379 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
379 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
372 aa  359  4e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  53.58 
 
 
381 aa  358  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  51.31 
 
 
381 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  50.66 
 
 
378 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  50.78 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  51.47 
 
 
376 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  50.8 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
377 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  51.86 
 
 
378 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  50.81 
 
 
374 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
377 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  49.73 
 
 
376 aa  354  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  51.99 
 
 
373 aa  352  4e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  47.49 
 
 
385 aa  352  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  51.07 
 
 
375 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
376 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.66 
 
 
377 aa  348  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  52.01 
 
 
376 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  49.33 
 
 
389 aa  347  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  51.87 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  51.87 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  51.87 
 
 
378 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
380 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  52.14 
 
 
378 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  52.14 
 
 
378 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  48.93 
 
 
379 aa  346  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  51.87 
 
 
378 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  52 
 
 
379 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  48.93 
 
 
379 aa  346  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  50.93 
 
 
375 aa  345  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  50.13 
 
 
376 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  49.74 
 
 
383 aa  345  8e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  48.81 
 
 
375 aa  344  1e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  47.48 
 
 
379 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  51.34 
 
 
373 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>