38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2857 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2857  cytochrome c biogenesis factor-like protein  100 
 
 		 258 aa  501  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2929  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  41.2 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3408  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  33.19 
 
 		 393 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2001  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  28.21 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3450  tetratricopeptide TPR_4  32.75 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0938  tetratricopeptide domain-containing protein  35.22 
 
 		 360 aa  75.5  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1834  tetratricopeptide TPR_2  31.02 
 
 		 367 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1362  cycH protein  31.88 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2130  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.26 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74489  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4054  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331246  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3778  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3071  cytochrome c-type biogenesis protein cycH  28.46 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0633  cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  30.74 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1191  cytochrome c-type biogenesis protein cycH / CcmH  32.33 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  33 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4991  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.84 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1437  cytochrome c-type biogenesis protein CycH / CcmH  30.33 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0436  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  30.17 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1656  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  27.07 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1372  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3248  tetratricopeptide TPR_2  28.93 
 
 		 433 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0606  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  26.01 
 
 		 390 aa  48.9  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1952  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 424 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0032  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.949797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2671  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  27.41 
 
 		 379 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 		 466 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1403  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.94 
 
 		 516 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489784 
 
 
-
 
NC_004310  BR0607  cytochrome c-type biogenesis protein, putative  25.55 
 
 		 379 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2182  cytochrome c-type biogenesis protein CycH  31.79 
 
 		 406 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.999893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2393  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00681412  hitchhiker  0.000021772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1683  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.6 
 
 		 523 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0377  putative cytochrome c-type biogenesis protein  27.47 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0131086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 399 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2230  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  25.67 
 
 		 384 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.863984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1408  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  27.53 
 
 		 552 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.381184  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1510  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 395 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>