More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3360 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  47.34 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  47.34 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  50.99 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 216 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  52.11 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 201 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  48.77 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  44.04 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 266 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  36.23 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  50.7 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 268 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 299 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  74.19 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>