263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1664 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  359  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  38.51 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  54.84 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  31.67 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.74 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  47.83 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 299 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 245 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  28.18 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  50 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>