More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2292 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  62.18 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  62.23 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  60.85 
 
 		 190 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 187 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  58.6 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  55.03 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  56.15 
 
 		 187 aa  198  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  57.84 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  46.15 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  28.3 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  46.43 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  46.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  35.94 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  45.28 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>