More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0780 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  60.28 
 
 
142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  60.28 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  51.06 
 
 
142 aa  150  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  49.3 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  42.55 
 
 
150 aa  124  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  43.26 
 
 
150 aa  122  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
145 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.17 
 
 
164 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  38.41 
 
 
165 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.62 
 
 
180 aa  96.7  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  39.16 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  37.96 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.46 
 
 
148 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.04 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.97 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.14 
 
 
157 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  37.24 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.27 
 
 
150 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.62 
 
 
144 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.46 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  34.03 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.14 
 
 
156 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.62 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.5 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.33 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.41 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  30 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  34.75 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  34.29 
 
 
300 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  33.09 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.04 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.29 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
138 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.11 
 
 
290 aa  76.6  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  35.21 
 
 
141 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  31.69 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.21 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.11 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.8 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.79 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  30.99 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  29.37 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  32.88 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.65 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.71 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.97 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.79 
 
 
208 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.25 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.56 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  34.21 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  26.06 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.36 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  33.33 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.41 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.39 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  30.2 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.87 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  34.27 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.77 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  32.39 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  30.41 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  28.99 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  35.04 
 
 
283 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.41 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  31.03 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  34.51 
 
 
291 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  30.89 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.21 
 
 
288 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  30.07 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.47 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>