More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5527 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 213 aa  278  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  58.03 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  56.32 
 
 		 229 aa  207  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  53.62 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 199 aa  194  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  42.58 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  40.41 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  35.03 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  32.29 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>