270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3819 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3819  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  970    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4729  hypothetical protein  62.85 
 
 
476 aa  624  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2571  peptidase, M20/M25/M40 family  61.67 
 
 
475 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1486  hypothetical protein  62.18 
 
 
473 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664586  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1506  hypothetical protein  62.39 
 
 
473 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2262  hypothetical protein  60.08 
 
 
475 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1764  hypothetical protein  62.47 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278132  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5121  hypothetical protein  60.93 
 
 
475 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1110  hypothetical protein  61.32 
 
 
473 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1590  hypothetical protein  61.32 
 
 
473 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1567  hypothetical protein  61.32 
 
 
473 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4728  hypothetical protein  60.68 
 
 
473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  60.38 
 
 
490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1647  hypothetical protein  61.56 
 
 
477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2519  hypothetical protein  60.21 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3502  hypothetical protein  58.81 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.67786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1265  hypothetical protein  60.21 
 
 
472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  59.07 
 
 
473 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1341  hypothetical protein  60.26 
 
 
472 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1159  hypothetical protein  59.78 
 
 
473 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1675  hypothetical protein  57.76 
 
 
473 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3119  hypothetical protein  57.23 
 
 
475 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2971  hypothetical protein  57.63 
 
 
478 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3123  hypothetical protein  55.89 
 
 
475 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3625  hypothetical protein  57.96 
 
 
472 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2529  hypothetical protein  57.63 
 
 
468 aa  531  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2929  hypothetical protein  56.6 
 
 
475 aa  527  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1721  hypothetical protein  56.25 
 
 
468 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2217  hypothetical protein  56.29 
 
 
472 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1646  hypothetical protein  53.03 
 
 
460 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3597  hypothetical protein  51.91 
 
 
463 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  49.15 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3415  hypothetical protein  50 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4152  hypothetical protein  48.81 
 
 
467 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  44.37 
 
 
471 aa  363  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  29.87 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.58 
 
 
451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.49 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  30.13 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  29 
 
 
455 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.51 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  28.33 
 
 
462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  29.8 
 
 
451 aa  126  8.000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  30.05 
 
 
453 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.47 
 
 
445 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.87 
 
 
456 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  29.84 
 
 
456 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.75 
 
 
455 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  27.3 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  26.58 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.16 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  29.84 
 
 
453 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2605  peptidase dimerization domain protein  27.83 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3993  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  27.25 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2325  peptidase dimerisation domain protein  26.67 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  29.03 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  30.05 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  30.05 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  30.05 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  32.66 
 
 
452 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3920  peptidase dimerisation domain protein  26.21 
 
 
497 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.49046  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4034  peptidase dimerisation domain protein  26.21 
 
 
544 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.957672  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  27.63 
 
 
467 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  27.07 
 
 
448 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.54 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.76 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  27.57 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  27.44 
 
 
456 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  26.91 
 
 
448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  27.97 
 
 
457 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1640  hypothetical protein  26.26 
 
 
458 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  28.98 
 
 
479 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  28.37 
 
 
470 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  27.38 
 
 
465 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  28.73 
 
 
464 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  26.82 
 
 
459 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  25.24 
 
 
458 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  26.89 
 
 
465 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  26.89 
 
 
465 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  27.18 
 
 
472 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  26.7 
 
 
460 aa  103  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  27.29 
 
 
463 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  27.29 
 
 
455 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1520  peptidase M20  26.73 
 
 
488 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.305754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  27.2 
 
 
458 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  26.27 
 
 
455 aa  101  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  27.4 
 
 
470 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  28.27 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  28 
 
 
460 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  27.25 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  29.11 
 
 
452 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  27.02 
 
 
445 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  26.99 
 
 
467 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  26.99 
 
 
484 aa  96.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.81 
 
 
463 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  27.68 
 
 
461 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1258  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.21 
 
 
513 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  24.54 
 
 
448 aa  94  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  25.77 
 
 
458 aa  94  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  26.44 
 
 
457 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>