283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5018 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  96.41 
 
 		 781 aa  1484    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 763 aa  1527    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  79.18 
 
 		 782 aa  1231    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  49.55 
 
 		 713 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  51.83 
 
 		 713 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  38.79 
 
 		 785 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  43.69 
 
 		 1079 aa  67.8  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 		 768 aa  64.7  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  44.44 
 
 		 2911 aa  63.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.46 
 
 		 5839 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.38 
 
 		 5962 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.52 
 
 		 2678 aa  61.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  45.98 
 
 		 2342 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  45.98 
 
 		 2342 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  43.56 
 
 		 2950 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  55.17 
 
 		 6753 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  55.17 
 
 		 9030 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  53.45 
 
 		 5218 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.41 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  40 
 
 		 2775 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1538 aa  59.3  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  38.89 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1424 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  53.45 
 
 		 8682 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  34.97 
 
 		 2743 aa  57.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  42.06 
 
 		 1883 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  49.15 
 
 		 7284 aa  57  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  36.45 
 
 		 2182 aa  57.4  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  39.33 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 		 932 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 		 1400 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  35.09 
 
 		 688 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  39.36 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.62 
 
 		 2239 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  47.62 
 
 		 6662 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.62 
 
 		 6683 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  48.05 
 
 		 219 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  47.62 
 
 		 6779 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  51.72 
 
 		 3427 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 		 1534 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  54.17 
 
 		 1202 aa  55.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  55.17 
 
 		 1712 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.42 
 
 		 3977 aa  55.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.24 
 
 		 2667 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  36.29 
 
 		 928 aa  55.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  60.87 
 
 		 4678 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  47.83 
 
 		 1112 aa  54.7  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.89 
 
 		 5098 aa  54.3  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  52.94 
 
 		 1499 aa  54.3  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  58 
 
 		 4122 aa  54.3  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  51.79 
 
 		 4687 aa  54.3  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 1582 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  54.55 
 
 		 3954 aa  54.3  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  44.93 
 
 		 728 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  52.94 
 
 		 1156 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  50.77 
 
 		 2704 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02754  hypothetical protein  50.82 
 
 		 236 aa  53.9  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  55.32 
 
 		 998 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  54.55 
 
 		 4334 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  36.21 
 
 		 2887 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  41.57 
 
 		 686 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  44.29 
 
 		 559 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  48.72 
 
 		 946 aa  53.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 		 2097 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  52.73 
 
 		 2542 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1049  hemolysin-type calcium-binding region  57.14 
 
 		 370 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.416377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  44.68 
 
 		 709 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.96 
 
 		 547 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  49.15 
 
 		 3209 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  50.82 
 
 		 561 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  44.71 
 
 		 2885 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.78 
 
 		 260 aa  52.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  53.23 
 
 		 1855 aa  52.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.67 
 
 		 3598 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  44.44 
 
 		 2567 aa  52  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  36.84 
 
 		 615 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  53.7 
 
 		 1699 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  35.85 
 
 		 1757 aa  52  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  33.33 
 
 		 686 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  43.16 
 
 		 1764 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  42.68 
 
 		 589 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  53.45 
 
 		 1145 aa  52  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  60 
 
 		 757 aa  51.6  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  30.11 
 
 		 1166 aa  52  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  46.58 
 
 		 1532 aa  51.6  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 		 219 aa  51.6  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  31.51 
 
 		 5123 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  41.89 
 
 		 739 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  54.17 
 
 		 2537 aa  51.6  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  40.85 
 
 		 4791 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.55 
 
 		 4220 aa  51.6  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1526 aa  51.2  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 		 1286 aa  51.6  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.31 
 
 		 2346 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  49.18 
 
 		 221 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  51.79 
 
 		 1055 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  35.78 
 
 		 3587 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  44.87 
 
 		 5769 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  35.78 
 
 		 3587 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  53.19 
 
 		 2467 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>