120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2754 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  100 
 
 		 341 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  58.7 
 
 		 500 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  36.33 
 
 		 638 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  32.84 
 
 		 471 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.34 
 
 		 458 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  36.36 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  33.95 
 
 		 570 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  35.18 
 
 		 871 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  38.68 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  32.33 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.12 
 
 		 735 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  36.08 
 
 		 641 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  27.37 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  26.56 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  35.96 
 
 		 360 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  30.63 
 
 		 1200 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.58 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1001 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  28 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  28 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  35.62 
 
 		 153 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.25 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  31.03 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  32.86 
 
 		 1628 aa  75.5  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.29 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.69 
 
 		 677 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 		 899 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  25.06 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  25.51 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  25.26 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  25.26 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  27.32 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  24.66 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  26.61 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  25.28 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.28 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.28 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  49.45 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  26.02 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  26.42 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  25.47 
 
 		 648 aa  67  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  34.94 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  31.39 
 
 		 972 aa  66.6  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  29.61 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25.96 
 
 		 423 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  24.46 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  32.34 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  25.14 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.01 
 
 		 940 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  32.62 
 
 		 1332 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  25.07 
 
 		 428 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  21.65 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  31.95 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  24.86 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  24.71 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  22.81 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  24.71 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  26.55 
 
 		 960 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  24.86 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.13 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  23.99 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  21.13 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  23.72 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  25.19 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  21.68 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  24.65 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  21.37 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  31.58 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  25.1 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  35 
 
 		 550 aa  55.8  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  32.91 
 
 		 831 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  21.37 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.92 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.68 
 
 		 1931 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  29.27 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  21.43 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.3 
 
 		 459 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  26.21 
 
 		 1242 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  21.67 
 
 		 428 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  23.45 
 
 		 2036 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  29.03 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  28.96 
 
 		 505 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  23.94 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  28.05 
 
 		 804 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.93 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.69 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  26.26 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.93 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  29.1 
 
 		 724 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  25.63 
 
 		 820 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  22.8 
 
 		 1969 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  29.44 
 
 		 892 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  22.87 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  24.53 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.37 
 
 		 467 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  23 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  32.53 
 
 		 1025 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  25.78 
 
 		 805 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.09 
 
 		 647 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>