More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3096 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1030 aa  2068    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  41.58 
 
 
1033 aa  798    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  42.16 
 
 
1036 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  39.96 
 
 
1063 aa  782    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  40.87 
 
 
1041 aa  784    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  41.36 
 
 
1034 aa  790    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  40.49 
 
 
1041 aa  799    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  59.45 
 
 
1035 aa  1186    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 
1033 aa  823    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  41.67 
 
 
1035 aa  796    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 
1067 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 
1067 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 
1063 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 
1067 aa  552  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 
1063 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.28 
 
 
1067 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 
1063 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 
1063 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 
1063 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 
1040 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 
1074 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.04 
 
 
1041 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 
1049 aa  522  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 
1050 aa  523  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 
1121 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  29.52 
 
 
1052 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 
1048 aa  512  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 
1032 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 
1055 aa  505  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 
1043 aa  505  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.61 
 
 
1067 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  29.82 
 
 
1044 aa  498  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  31.36 
 
 
1039 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 
1053 aa  489  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 
1038 aa  483  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1050 aa  472  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 
1054 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  30.02 
 
 
1042 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.02 
 
 
1075 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 
1034 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 
1054 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 
1053 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 
1073 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 
1053 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.3 
 
 
1074 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  27.93 
 
 
1056 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 
1060 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 
1060 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 
1033 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 
1060 aa  452  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 
1057 aa  452  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 
1061 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 
1053 aa  452  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  29.39 
 
 
1048 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 
1069 aa  445  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 
1048 aa  445  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.04 
 
 
1093 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 
1051 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 
1064 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 
1068 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1062 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  28.4 
 
 
1050 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  27.59 
 
 
1052 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  28.57 
 
 
1071 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 
1041 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.33 
 
 
1054 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.82 
 
 
1060 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 
1066 aa  400  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 
1072 aa  398  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 
1098 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  25.82 
 
 
1053 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 
1035 aa  376  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.42 
 
 
1135 aa  360  6e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 
1011 aa  358  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 
1044 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 
1030 aa  354  5.9999999999999994e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 
1131 aa  352  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 
1051 aa  343  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 
1038 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 
1043 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 
1137 aa  332  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 
1031 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.48 
 
 
1036 aa  327  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 
1030 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 
1034 aa  324  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 
1025 aa  323  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 
1028 aa  321  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 
1055 aa  321  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26 
 
 
1043 aa  320  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 
1028 aa  319  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 
1031 aa  318  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 
1031 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 
1031 aa  317  9e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 
1034 aa  317  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.5 
 
 
1024 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 
1050 aa  317  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 
1031 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 
1031 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 
1031 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 
1044 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>