More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1543 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  100 
 
 		 469 aa  943    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  66.89 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 459 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  67.1 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  67.69 
 
 		 459 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  66.23 
 
 		 459 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  66.01 
 
 		 459 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  66.01 
 
 		 461 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  67.46 
 
 		 462 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  66.67 
 
 		 458 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  65.35 
 
 		 458 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  66.23 
 
 		 461 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  64.47 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  66.81 
 
 		 456 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  63.24 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  65.13 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  64.29 
 
 		 448 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  63.44 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  60.43 
 
 		 469 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  60.44 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  61.25 
 
 		 460 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  63.26 
 
 		 463 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  61.81 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  61.59 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  63.52 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  64.4 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  60.93 
 
 		 457 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  58.99 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  58.09 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  56.67 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  56.21 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  61.62 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  53.83 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  56.45 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  55.34 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.42 
 
 		 472 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  52.08 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  53.11 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  55.11 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.52 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  55.97 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  54.22 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  55.66 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  55.56 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  54.17 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  56.39 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  51.74 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  52.22 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  51.93 
 
 		 473 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  54.32 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  54.45 
 
 		 463 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  52.41 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  53.45 
 
 		 468 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  52.84 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.85 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  54.87 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 474 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  51.92 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  54.45 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  48.69 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 473 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  53.85 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  52.64 
 
 		 472 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  55.38 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  47.03 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  47.2 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  48.13 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  49.89 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  48.57 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 631 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  49.56 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  46.72 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  46.44 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  46.15 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  50.11 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  51.33 
 
 		 463 aa  412  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  48.01 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>