More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6111 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  43.21 
 
 		 1368 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  42.77 
 
 		 1681 aa  855    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  47.31 
 
 		 1710 aa  974    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  45.98 
 
 		 1599 aa  1185    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  100 
 
 		 1558 aa  3143    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  30.77 
 
 		 1464 aa  223  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.96 
 
 		 2096 aa  199  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.99 
 
 		 1271 aa  199  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.57 
 
 		 2149 aa  199  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1600 aa  188  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1352 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.86 
 
 		 1485 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 2035 aa  162  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.74 
 
 		 2277 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.68 
 
 		 1381 aa  157  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.39 
 
 		 3027 aa  156  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.79 
 
 		 1345 aa  151  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.79 
 
 		 1345 aa  151  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.42 
 
 		 1008 aa  147  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.42 
 
 		 1008 aa  147  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.74 
 
 		 1953 aa  145  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.29 
 
 		 2225 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.33 
 
 		 765 aa  140  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25 
 
 		 2221 aa  139  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.33 
 
 		 2224 aa  139  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.33 
 
 		 2224 aa  139  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1197 aa  139  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.21 
 
 		 2224 aa  138  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.33 
 
 		 2246 aa  138  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1551 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1554 aa  135  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1611 aa  135  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.79 
 
 		 1488 aa  134  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1840 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.63 
 
 		 2178 aa  132  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.45 
 
 		 1560 aa  132  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.2 
 
 		 1981 aa  131  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.12 
 
 		 1568 aa  131  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.13 
 
 		 1429 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.38 
 
 		 1509 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 3193 aa  130  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.81 
 
 		 1485 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1669 aa  129  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1520 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1527 aa  127  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1547 aa  126  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1550 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.4 
 
 		 924 aa  123  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  24.77 
 
 		 1457 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.33 
 
 		 1467 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.3 
 
 		 678 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1433 aa  122  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1390 aa  122  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  25.36 
 
 		 931 aa  122  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.17 
 
 		 2731 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  27.34 
 
 		 909 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 927 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1935 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1400 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  27.6 
 
 		 1160 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.07 
 
 		 1348 aa  119  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.04 
 
 		 1576 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1531 aa  118  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  24.54 
 
 		 1423 aa  118  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.61 
 
 		 1614 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  24.87 
 
 		 1437 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.04 
 
 		 1447 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  39.51 
 
 		 335 aa  116  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1602 aa  116  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 972 aa  116  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  24.54 
 
 		 1475 aa  115  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.81 
 
 		 889 aa  115  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.07 
 
 		 903 aa  115  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  22.57 
 
 		 2831 aa  115  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 866 aa  115  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.21 
 
 		 1411 aa  115  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_003296  RS05520  hypothetical protein  49.55 
 
 		 237 aa  115  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  22.71 
 
 		 1732 aa  115  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1422 aa  115  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1942 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.18 
 
 		 1259 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1917 aa  114  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1189 aa  114  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.43 
 
 		 1572 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 867 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 3689 aa  113  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.18 
 
 		 788 aa  113  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.43 
 
 		 764 aa  113  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.18 
 
 		 788 aa  113  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1386 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 		 2961 aa  112  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.66 
 
 		 1595 aa  112  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.68 
 
 		 1609 aa  112  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.03 
 
 		 1586 aa  112  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  23.84 
 
 		 1385 aa  111  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  26.42 
 
 		 1673 aa  111  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.74 
 
 		 1543 aa  111  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  28.07 
 
 		 1991 aa  111  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.24 
 
 		 738 aa  110  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 3073 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>