More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3300 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  61.78 
 
 		 570 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24650  glycosidase  62.61 
 
 		 567 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 560 aa  1109    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  62.65 
 
 		 568 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  61.9 
 
 		 572 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00610  alpha-glucosidase, putative  55.52 
 
 		 563 aa  625  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2119  alpha amylase catalytic region  60.32 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  58.41 
 
 		 539 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  55.58 
 
 		 566 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5893  alpha amylase catalytic region  54 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  56.81 
 
 		 544 aa  534  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1495  glycosidase  51.62 
 
 		 556 aa  529  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  52.02 
 
 		 563 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  48.75 
 
 		 604 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  48.71 
 
 		 593 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  51.43 
 
 		 570 aa  511  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  53.32 
 
 		 522 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  53.37 
 
 		 571 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  49.66 
 
 		 605 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  51.89 
 
 		 540 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2176  alpha amylase catalytic region  51.58 
 
 		 567 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.374326  normal  0.160369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1134  alpha amylase catalytic region  53.25 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  51.27 
 
 		 533 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3342  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.9 
 
 		 538 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.0532512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  52.01 
 
 		 565 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  51.64 
 
 		 538 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  47.74 
 
 		 560 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1532  alpha amylase catalytic region  53.05 
 
 		 532 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  51.45 
 
 		 554 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3538  alpha amylase catalytic region  52.95 
 
 		 546 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489113  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  48.05 
 
 		 576 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  50.71 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  49.01 
 
 		 544 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2111  alpha amylase catalytic region  49.91 
 
 		 555 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  47.52 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  51.4 
 
 		 599 aa  467  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  48.29 
 
 		 534 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  50.19 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  47.72 
 
 		 609 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  51.19 
 
 		 550 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  48.66 
 
 		 543 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  51.36 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0745  alpha amylase catalytic region  49.15 
 
 		 543 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215044  hitchhiker  0.000627206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  51.11 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6925  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  48.35 
 
 		 545 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  47.03 
 
 		 607 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3695  alpha amylase catalytic region  46.63 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  47.93 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1390  alpha amylase catalytic region  46.07 
 
 		 533 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.794681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  47.87 
 
 		 558 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2030  alpha amylase catalytic region  46.15 
 
 		 587 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3708  alpha amylase catalytic region  48.63 
 
 		 549 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503251  hitchhiker  0.00685051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27360  glycosidase  49.37 
 
 		 554 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155559  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  48.45 
 
 		 546 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  48.27 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2798  alpha amylase catalytic region  47.99 
 
 		 548 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4692  alpha amylase catalytic region  46.09 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375992  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1150  alpha amylase, catalytic region  47.19 
 
 		 634 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  46 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  47.24 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  46.88 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0743  alpha amylase, catalytic region  47.36 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  46.88 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4117  alpha amylase catalytic region  51.71 
 
 		 548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.357071  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6968  alpha amylase catalytic region  45.36 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  42.23 
 
 		 544 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1794  alpha amylase catalytic region  44.36 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2320  alpha amylase catalytic region  41.55 
 
 		 547 aa  322  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1017  alpha amylase catalytic region  40.56 
 
 		 537 aa  312  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.487933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  38.39 
 
 		 532 aa  312  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0021  alpha amylase catalytic region  36.83 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193993  normal  0.266827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  39.02 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  38.91 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  38.78 
 
 		 548 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  39.22 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  37.64 
 
 		 525 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  41.26 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  38.24 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  37.04 
 
 		 553 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0416  alpha amylase catalytic region  41.06 
 
 		 557 aa  297  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.78 
 
 		 515 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1662  alpha amylase, catalytic region  37.59 
 
 		 544 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723863  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2213  oligo-1,6-glucosidase  36.52 
 
 		 540 aa  289  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3304  alpha amylase, catalytic region  37.83 
 
 		 550 aa  289  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.251779  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0788  alpha-glucosidase  36.31 
 
 		 550 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  36.08 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0029  alpha amylase, catalytic region  38.95 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  37.36 
 
 		 550 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  36.58 
 
 		 535 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  37.02 
 
 		 536 aa  286  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  34.2 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0984  alpha amylase family protein  36.28 
 
 		 538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  37.11 
 
 		 538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2620  alpha amylase catalytic region  38.48 
 
 		 560 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0390  alpha amylase catalytic region  36.63 
 
 		 550 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622906  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2209  alpha amylase, catalytic region  36.67 
 
 		 540 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  35.12 
 
 		 556 aa  283  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  38.09 
 
 		 552 aa  283  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2311  alpha amylase, catalytic region  36.99 
 
 		 540 aa  283  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.679266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1889  alpha amylase, catalytic region  34.71 
 
 		 541 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>