More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2268 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
413 aa  850    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  36.1 
 
 
403 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  35.7 
 
 
407 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.88 
 
 
406 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.88 
 
 
406 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  33.58 
 
 
411 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  37.43 
 
 
401 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 
453 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 
459 aa  222  9e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  32.91 
 
 
470 aa  219  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 
392 aa  209  5e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
406 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
414 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.08 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
397 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.18 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.25 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
381 aa  130  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
428 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
432 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
434 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
402 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 
339 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 
417 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 
413 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 
413 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.88 
 
 
378 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2205  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
376 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  23.36 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
379 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
386 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.8 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  22.69 
 
 
416 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.92 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  23 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  22.28 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  22.41 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  21.69 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  22.68 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  22.67 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.21 
 
 
403 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3836  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.335848  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  23.7 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  22.96 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  23.12 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  21.4 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 
373 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  22.76 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3025  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  22.29 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0781  extracellular ligand-binding receptor  21.41 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23.12 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  20.75 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  22.45 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  22.41 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.71 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  22.03 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  23.76 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  24.31 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>