More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3525 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 603 aa  1216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 815 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 662 aa  146  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.5 
 
 		 1663 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.87 
 
 		 783 aa  144  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 681 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 215 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 1654 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.5 
 
 		 1668 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.49 
 
 		 744 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 593 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 592 aa  138  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 593 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1093 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 771 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 382 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 462 aa  134  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  39.25 
 
 		 344 aa  134  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 764 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 752 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 488 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 3706 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 872 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 1253 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 1093 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 964 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 363 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 406 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 749 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 1093 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 1714 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 1560 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 551 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 832 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 360 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 746 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 362 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 532 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 698 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 1239 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 839 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 834 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 945 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 704 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 682 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 358 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1182 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 437 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.09 
 
 		 754 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 358 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 381 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.41 
 
 		 348 aa  120  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.11 
 
 		 381 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 788 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 2693 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 1676 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 941 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 366 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 782 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3963  signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 538 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  37.69 
 
 		 366 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1210 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 347 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 416 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 991 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 648 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 362 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1227 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 381 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.92 
 
 		 918 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 387 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 354 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 856 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 813 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 1246 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 572 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 693 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 723 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 382 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.03 
 
 		 338 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.79 
 
 		 1248 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 936 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 351 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 767 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 790 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>