More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2700 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  84.73 
 
 		 593 aa  961    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  84.56 
 
 		 593 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 592 aa  1187    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 597 aa  323  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 594 aa  306  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 613 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 662 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 603 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 570 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 585 aa  127  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 596 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.67 
 
 		 744 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 964 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 732 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 1239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 1253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 1560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 807 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.31 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 746 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 215 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 749 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 3706 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 764 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 856 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 347 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 1246 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 752 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 813 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 815 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 1390 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1714 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 991 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 1183 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 1654 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1093 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 354 aa  103  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 545 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 723 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 1177 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  32.86 
 
 		 344 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1093 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 782 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 732 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 834 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 747 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 790 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 2693 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 874 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 771 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 613 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3926  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 512 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 771 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 681 aa  97.8  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 945 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 788 aa  97.4  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 913 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 416 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 488 aa  97.4  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 839 aa  97.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 864 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 1205 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 941 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.68 
 
 		 895 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 875 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.03 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 659 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 674 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 756 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 657 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 348 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 551 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 878 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 767 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 871 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 616 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 406 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 739 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  27.88 
 
 		 344 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 1676 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 832 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 344 aa  92  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 495 aa  91.7  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 932 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 348 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 709 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 704 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 1051 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>