More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4020 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  83.24 
 
 		 1000 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 959 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 910 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.18 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  37.84 
 
 		 893 aa  95.9  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 927 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 881 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 881 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 876 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  37.62 
 
 		 884 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  41.26 
 
 		 927 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 953 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 937 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  38.73 
 
 		 937 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  38.73 
 
 		 937 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  40.56 
 
 		 928 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 879 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 		 913 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 894 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.43 
 
 		 923 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 		 911 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  38.69 
 
 		 930 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 894 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  33.5 
 
 		 929 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 		 928 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 909 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 938 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  40.65 
 
 		 884 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.86 
 
 		 917 aa  69.7  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 905 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  40.68 
 
 		 919 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.84 
 
 		 940 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 927 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 889 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  33.9 
 
 		 940 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 554 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 910 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 925 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  35.52 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 929 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 544 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 936 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  42.96 
 
 		 904 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  43.33 
 
 		 892 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.78 
 
 		 961 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 995 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  34.56 
 
 		 922 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 920 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 919 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 918 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  34.96 
 
 		 928 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 932 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 119 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 903 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  31.41 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 915 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 923 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  38.94 
 
 		 923 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  35.57 
 
 		 955 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  33.89 
 
 		 913 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 		 923 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  34.55 
 
 		 929 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.46 
 
 		 913 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 916 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.86 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 998 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 943 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  34.48 
 
 		 862 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 946 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.65 
 
 		 862 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 545 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  30.37 
 
 		 921 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 993 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 921 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  60.42 
 
 		 431 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  35.05 
 
 		 921 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  35.57 
 
 		 921 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 421 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  47.06 
 
 		 894 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  46.03 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 1030 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 552 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 953 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  30.73 
 
 		 934 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  58.33 
 
 		 758 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 956 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>