106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0363 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  100 
 
 		 765 aa  1519    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  25.99 
 
 		 730 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  29.7 
 
 		 732 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  27.34 
 
 		 773 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 		 729 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  28.3 
 
 		 731 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  30.14 
 
 		 680 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  31.07 
 
 		 714 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  29.77 
 
 		 470 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  31.56 
 
 		 681 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  31.56 
 
 		 868 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  31.36 
 
 		 1003 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.97 
 
 		 733 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  29.59 
 
 		 1000 aa  151  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 		 465 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 		 968 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  29.08 
 
 		 922 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  29.08 
 
 		 968 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  30.47 
 
 		 398 aa  146  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  27.87 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.67 
 
 		 769 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  26.79 
 
 		 836 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.79 
 
 		 836 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  26.79 
 
 		 836 aa  135  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 863 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  26.79 
 
 		 863 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  27.03 
 
 		 863 aa  134  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  26.79 
 
 		 429 aa  134  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  26.21 
 
 		 638 aa  130  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  26.21 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  26.21 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  26.81 
 
 		 747 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  27.1 
 
 		 1541 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  26.67 
 
 		 1441 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1008 aa  116  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  27.82 
 
 		 562 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  27.52 
 
 		 1117 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  24.14 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  23.85 
 
 		 759 aa  108  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  23.56 
 
 		 759 aa  106  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25.2 
 
 		 955 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.15 
 
 		 955 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25.15 
 
 		 955 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25.2 
 
 		 955 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  24.8 
 
 		 961 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1565 aa  91.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1571 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.17 
 
 		 1526 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  25.17 
 
 		 1526 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  28.36 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  22.64 
 
 		 815 aa  77.4  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  23.26 
 
 		 800 aa  77  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  22.95 
 
 		 947 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3921  outer membrane autotransporter  23.71 
 
 		 1269 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.728778 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.84 
 
 		 1099 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.76 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.64 
 
 		 1115 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 997 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  22.3 
 
 		 1067 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  24.83 
 
 		 1234 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  24.57 
 
 		 763 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.72 
 
 		 1806 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.87 
 
 		 1093 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.87 
 
 		 1093 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  24.83 
 
 		 1250 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.83 
 
 		 1234 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  27.33 
 
 		 1004 aa  54.3  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.3 
 
 		 1327 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  23.83 
 
 		 1234 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  24.41 
 
 		 759 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 		 909 aa  53.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.56 
 
 		 1358 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  22.3 
 
 		 466 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  25.09 
 
 		 1254 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  23.15 
 
 		 1250 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  24.13 
 
 		 1252 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.03 
 
 		 806 aa  50.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  25.95 
 
 		 1040 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  23.29 
 
 		 1770 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  23.26 
 
 		 1748 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  25.93 
 
 		 907 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  22.22 
 
 		 1070 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 		 2637 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  21.88 
 
 		 3322 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  21.86 
 
 		 1070 aa  48.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  24.37 
 
 		 358 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1165 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1165 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  21.43 
 
 		 1234 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  21.67 
 
 		 820 aa  47.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  24.23 
 
 		 1594 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  28.87 
 
 		 108 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  23.19 
 
 		 389 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  23.55 
 
 		 358 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  27.1 
 
 		 136 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  24.48 
 
 		 773 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  23.42 
 
 		 1770 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  20.87 
 
 		 864 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  24.12 
 
 		 358 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  21.96 
 
 		 1102 aa  44.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>