29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1114 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
1358 aa  2706    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0687  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.92 
 
 
1044 aa  488  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0892  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.22 
 
 
815 aa  104  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1620  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.32 
 
 
1054 aa  83.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.97 
 
 
1242 aa  70.1  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  22.32 
 
 
1369 aa  66.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  25 
 
 
831 aa  63.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_002620  TC0263  polymorphic membrane protein G family protein  24.88 
 
 
987 aa  58.5  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.45 
 
 
763 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.45 
 
 
759 aa  57  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.02 
 
 
575 aa  55.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  25.77 
 
 
1068 aa  53.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  27.17 
 
 
765 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.14 
 
 
1865 aa  52.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.14 
 
 
1842 aa  52  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.14 
 
 
2302 aa  51.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0261  polymorphic membrane protein E/F family protein  27.62 
 
 
976 aa  50.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.95 
 
 
1489 aa  50.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.28 
 
 
1673 aa  49.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  26.94 
 
 
2003 aa  49.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  25.71 
 
 
980 aa  48.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.99 
 
 
1769 aa  48.5  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.61 
 
 
1953 aa  48.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.61 
 
 
3015 aa  47  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.57 
 
 
1154 aa  45.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  25.56 
 
 
994 aa  45.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  22.15 
 
 
1677 aa  45.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  32.85 
 
 
575 aa  45.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.48 
 
 
991 aa  45.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>