More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0301 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  53.67 
 
 		 662 aa  717    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0702  NAD-dependent DNA ligase  84.3 
 
 		 677 aa  1189    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0301  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 676 aa  1394    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.10932  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2876  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.74 
 
 		 719 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0956415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2432  DNA ligase, NAD-dependent  43.69 
 
 		 710 aa  582  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.71 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2579  NAD-dependent DNA ligase LigA  42 
 
 		 718 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  41.87 
 
 		 700 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6162  DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase (NAD+))  42.9 
 
 		 716 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2840  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.71 
 
 		 718 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229062  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  41.46 
 
 		 708 aa  572  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  42.12 
 
 		 714 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  41.79 
 
 		 699 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  42.49 
 
 		 715 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  40.8 
 
 		 716 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  43.34 
 
 		 698 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1509  DNA ligase  40.29 
 
 		 741 aa  557  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.655718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  41.37 
 
 		 714 aa  558  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1754  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.7 
 
 		 721 aa  555  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2070  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.96 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  41.74 
 
 		 720 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  41.92 
 
 		 714 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0500  DNA ligase, NAD-dependent  43.88 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.147098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1159  DNA ligase, NAD-dependent  42.39 
 
 		 704 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.227634  normal  0.637978 
 
 
-
 
NC_004310  BR1420  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.6 
 
 		 719 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1280  DNA ligase, NAD-dependent  41.67 
 
 		 704 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.334632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1376  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.6 
 
 		 719 aa  548  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1997  DNA ligase, NAD-dependent  41.51 
 
 		 703 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2622  DNA ligase  41.8 
 
 		 704 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.477478  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2066  DNA ligase, NAD-dependent  40.44 
 
 		 701 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4083  DNA ligase, NAD-dependent  39.3 
 
 		 765 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316882  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 		 694 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 673 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2504  DNA ligase, NAD-dependent  39.23 
 
 		 752 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.234774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4727  DNA ligase, NAD-dependent  37.38 
 
 		 708 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  41.08 
 
 		 704 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  38.95 
 
 		 673 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  39.06 
 
 		 668 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  39.85 
 
 		 672 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  41.38 
 
 		 674 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  38.63 
 
 		 683 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  40.15 
 
 		 690 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0757  DNA ligase, NAD-dependent  41.79 
 
 		 682 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.55 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  38.55 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.72 
 
 		 671 aa  505  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.56 
 
 		 673 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  38.91 
 
 		 668 aa  505  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  39.41 
 
 		 685 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.55 
 
 		 671 aa  505  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.55 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  38.55 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1738  DNA ligase, NAD-dependent  35.82 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00107521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.55 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0549  DNA ligase, NAD-dependent  38.03 
 
 		 714 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183807  normal  0.14967 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.55 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.65 
 
 		 673 aa  503  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.46 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  39.29 
 
 		 672 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.58 
 
 		 681 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  39.24 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.31 
 
 		 670 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  39.71 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  39.12 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39 
 
 		 697 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.76 
 
 		 670 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  39.12 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.31 
 
 		 670 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.02 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1398  DNA ligase, NAD-dependent  38.34 
 
 		 739 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.695979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  39.32 
 
 		 690 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  38.95 
 
 		 690 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  38.3 
 
 		 673 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.32 
 
 		 670 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.85 
 
 		 671 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 		 670 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.85 
 
 		 671 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  39.08 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  38.85 
 
 		 670 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.59 
 
 		 669 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  39 
 
 		 671 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.76 
 
 		 682 aa  495  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  39.45 
 
 		 682 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  39 
 
 		 671 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  38.88 
 
 		 681 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  39 
 
 		 671 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  40.15 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.47 
 
 		 684 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  38.56 
 
 		 675 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  38.64 
 
 		 675 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  39.29 
 
 		 672 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  38.6 
 
 		 671 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.63 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  37.87 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  37.84 
 
 		 706 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  39.43 
 
 		 677 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  39.55 
 
 		 688 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  38.5 
 
 		 678 aa  485  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  39.49 
 
 		 672 aa  485  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  39.34 
 
 		 669 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>