282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0563 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  100 
 
 		 1706 aa  3294    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  36.63 
 
 		 2555 aa  352  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.53 
 
 		 3191 aa  291  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  33.81 
 
 		 5745 aa  269  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.28 
 
 		 4978 aa  245  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.87 
 
 		 1884 aa  240  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.56 
 
 		 3927 aa  238  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.3 
 
 		 1597 aa  231  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  32.82 
 
 		 3182 aa  194  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.88 
 
 		 4122 aa  194  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.57 
 
 		 2114 aa  189  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.84 
 
 		 4836 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  29.28 
 
 		 1269 aa  181  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  29.97 
 
 		 1268 aa  177  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  29.92 
 
 		 1269 aa  173  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.96 
 
 		 1599 aa  172  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.01 
 
 		 2812 aa  166  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.32 
 
 		 2839 aa  163  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30.35 
 
 		 16322 aa  162  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  30.9 
 
 		 1867 aa  156  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  29.87 
 
 		 3714 aa  154  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.58 
 
 		 994 aa  146  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.19 
 
 		 2816 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  31.54 
 
 		 3477 aa  142  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.86 
 
 		 4220 aa  141  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  30.28 
 
 		 892 aa  138  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.62 
 
 		 4848 aa  137  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.96 
 
 		 1141 aa  133  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.48 
 
 		 7284 aa  132  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.69 
 
 		 3474 aa  130  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.07 
 
 		 5787 aa  127  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.46 
 
 		 3816 aa  126  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.39 
 
 		 5442 aa  125  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.2 
 
 		 3363 aa  125  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  29.7 
 
 		 4854 aa  124  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  27.3 
 
 		 721 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  31.67 
 
 		 4791 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  26.24 
 
 		 2074 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.8 
 
 		 3508 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.75 
 
 		 850 aa  119  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.88 
 
 		 2807 aa  118  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  23.31 
 
 		 9867 aa  116  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  31.3 
 
 		 1215 aa  115  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  31.3 
 
 		 1215 aa  115  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  35.33 
 
 		 4285 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  32.9 
 
 		 2768 aa  112  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1215 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1215 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.15 
 
 		 3396 aa  110  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.89 
 
 		 8321 aa  109  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 1428 aa  109  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.62 
 
 		 369 aa  108  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1512 aa  108  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.3 
 
 		 1215 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  25.47 
 
 		 2767 aa  107  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 		 7149 aa  102  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  25.68 
 
 		 1367 aa  97.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.92 
 
 		 2377 aa  97.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  28.41 
 
 		 814 aa  97.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  26.86 
 
 		 2887 aa  96.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  28.9 
 
 		 2524 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.79 
 
 		 6683 aa  94.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1416 aa  94.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  30.79 
 
 		 6779 aa  94  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.96 
 
 		 761 aa  92.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  27.94 
 
 		 3439 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  31.17 
 
 		 6662 aa  91.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.88 
 
 		 1109 aa  88.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  25.05 
 
 		 2743 aa  85.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  36.92 
 
 		 2452 aa  83.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  25.4 
 
 		 16311 aa  83.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  27.7 
 
 		 2153 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  26.39 
 
 		 1363 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  36.21 
 
 		 2336 aa  79  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.64 
 
 		 2507 aa  78.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.9 
 
 		 2239 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  25.26 
 
 		 2784 aa  76.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  27.74 
 
 		 2353 aa  76.3  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 		 2345 aa  75.5  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1066 aa  75.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.58 
 
 		 1712 aa  75.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.29 
 
 		 3089 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1806 aa  73.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.21 
 
 		 5020 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  28.69 
 
 		 991 aa  71.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.56 
 
 		 2346 aa  71.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  28.81 
 
 		 2853 aa  70.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  28.87 
 
 		 1911 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1313  hypothetical protein  42.11 
 
 		 2202 aa  70.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  32.99 
 
 		 2890 aa  69.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  28.13 
 
 		 3229 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  25.66 
 
 		 5444 aa  68.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  37.79 
 
 		 4748 aa  67.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.11 
 
 		 2503 aa  66.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  36.71 
 
 		 3259 aa  66.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  38.85 
 
 		 6310 aa  66.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  38.85 
 
 		 8064 aa  66.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  27.48 
 
 		 2820 aa  65.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1699 aa  65.9  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  25.73 
 
 		 4661 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>