More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1307 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1307  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  38.24 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  34.26 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  35 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  37.14 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 497 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  35.96 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.57 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  44.23 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  35.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  35.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  35.37 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  35.37 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 414 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 400 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  45.45 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  30.19 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 424 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>