113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3903 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3903  PKD domain containing protein  100 
 
 
644 aa  1221    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2716  PKD domain containing protein  42 
 
 
664 aa  280  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575961  normal  0.0544825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  35.65 
 
 
669 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.76 
 
 
835 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.73 
 
 
835 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  32.5 
 
 
861 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  40.82 
 
 
943 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  37.76 
 
 
818 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  46.38 
 
 
792 aa  57.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 
778 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.7 
 
 
699 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  31.76 
 
 
777 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 
778 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 
778 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  40 
 
 
778 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.65 
 
 
929 aa  55.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  46.43 
 
 
948 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 
713 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.79 
 
 
836 aa  54.3  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  48.21 
 
 
948 aa  54.3  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  46.43 
 
 
948 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1158 aa  54.3  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  34.75 
 
 
780 aa  54.3  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  48.21 
 
 
948 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  42.67 
 
 
1309 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  38.46 
 
 
951 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  39.73 
 
 
820 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  31.53 
 
 
1084 aa  51.6  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  36.61 
 
 
1916 aa  51.6  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.56 
 
 
942 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.33 
 
 
971 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.46 
 
 
947 aa  51.2  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  29.27 
 
 
721 aa  50.8  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  48.98 
 
 
331 aa  50.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  36.96 
 
 
734 aa  50.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  42.22 
 
 
1150 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  33.87 
 
 
823 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.68 
 
 
940 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  30.94 
 
 
938 aa  50.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  46.43 
 
 
684 aa  50.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  35 
 
 
1565 aa  50.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  34.83 
 
 
873 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.17 
 
 
835 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  31.73 
 
 
967 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.89 
 
 
2554 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 
786 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  38.2 
 
 
3197 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  35.56 
 
 
1311 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  41.1 
 
 
945 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  37.04 
 
 
1367 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  35.45 
 
 
775 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  31.43 
 
 
2169 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 
1732 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.24 
 
 
816 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  42.86 
 
 
1094 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  33 
 
 
517 aa  48.5  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  26.5 
 
 
1104 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  39.39 
 
 
814 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  39.13 
 
 
840 aa  47.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 
3295 aa  47.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  34.13 
 
 
317 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  38.27 
 
 
865 aa  47.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  38.82 
 
 
3197 aa  47.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  38.81 
 
 
819 aa  47.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  29.6 
 
 
1194 aa  47.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  33.33 
 
 
960 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  34.57 
 
 
960 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  34.69 
 
 
2272 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  33.33 
 
 
960 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  39.34 
 
 
1104 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  33 
 
 
677 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  32.05 
 
 
1362 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  44.64 
 
 
871 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  40.91 
 
 
995 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  29.55 
 
 
965 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4102  PKD domain containing protein  35.37 
 
 
295 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774924  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  33.03 
 
 
865 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  36.11 
 
 
1667 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.35 
 
 
1292 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  40.91 
 
 
2066 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  32.69 
 
 
552 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  38.67 
 
 
944 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.99 
 
 
1620 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  31.73 
 
 
1556 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  39.71 
 
 
1057 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  28.36 
 
 
965 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  36.14 
 
 
1830 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  36.99 
 
 
1095 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  34.58 
 
 
2656 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  48.84 
 
 
871 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  28.36 
 
 
965 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  30 
 
 
1282 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  28.36 
 
 
965 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  37.7 
 
 
1862 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.57 
 
 
944 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.12 
 
 
773 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.48 
 
 
1356 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54.9 
 
 
945 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  37.68 
 
 
971 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  30.94 
 
 
965 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>