More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0836 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  403  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  48.97 
 
 		 217 aa  174  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  43.52 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  48.96 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  36.65 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  38.37 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  29.15 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.56 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.81 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>