More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0832 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
208 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
214 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 
188 aa  117  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
240 aa  111  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
202 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
256 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 
212 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
224 aa  104  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
217 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
189 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
208 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 
189 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
260 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 
252 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
216 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
192 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
209 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.6 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.05 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
222 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.75 
 
 
264 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  29.84 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
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NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603343 
 
 
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NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
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NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.18 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal 
 
 
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NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  32.31 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  29.57 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal 
 
 
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NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0994293 
 
 
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NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.84 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.98 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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