More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1030 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 274 aa  547  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3209  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.9 
 
 		 234 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00149401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0650  TPR domain-containing protein  37.02 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0639  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.554233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2234  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1946  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 718 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.4 
 
 		 571 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 3145 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.91 
 
 		 810 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.41 
 
 		 780 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 878 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.85 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 1421 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.51 
 
 		 745 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 685 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  31.17 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 562 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 827 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.32 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 935 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.71 
 
 		 1979 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 739 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.64 
 
 		 587 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.1 
 
 		 603 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 3035 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 557 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 612 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 909 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 632 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 824 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 		 599 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 582 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  30.69 
 
 		 480 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 607 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.83 
 
 		 816 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 927 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  28.66 
 
 		 430 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 643 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 574 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.73 
 
 		 725 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 586 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 968 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 581 aa  52.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 697 aa  52.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 714 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 733 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  25.77 
 
 		 577 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 593 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 646 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  23.44 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 700 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  24.43 
 
 		 436 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 649 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 1737 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 649 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 864 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 503 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.69 
 
 		 729 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 448 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  26.8 
 
 		 732 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 574 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 		 577 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.32 
 
 		 397 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 833 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 723 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  25.29 
 
 		 573 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 722 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 589 aa  49.7  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1121 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 		 637 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 		 565 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 607 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 357 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 681 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.55 
 
 		 795 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  23.13 
 
 		 690 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 544 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 804 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 543 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  23.81 
 
 		 609 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 595 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  24.57 
 
 		 587 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 833 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 599 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 828 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 613 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 573 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>