More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0807 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 358 aa  697    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  35.75 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  33.88 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  33.15 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  34.62 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  33.23 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  31.22 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  31.71 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  34 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  31.53 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  30.55 
 
 		 413 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 		 413 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.26 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  32.13 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  31.83 
 
 		 393 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  33.73 
 
 		 394 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  31.5 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  32.17 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  33.66 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.97 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  31.38 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  31.09 
 
 		 440 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 408 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  33.22 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.54 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  32 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  30.62 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 409 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  31.62 
 
 		 1405 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 		 390 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.37 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.06 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 396 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.67 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 609 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2084  RND efflux membrane fusion protein  28.65 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.14 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  28.78 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.37 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.37 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  29.5 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  31.66 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 379 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.45 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.18 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  25.5 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  28.52 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.87 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3611  secretion protein HlyD  31.06 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.711693  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  26.04 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  30.72 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3030  secretion protein HlyD  35.71 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0446257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 		 512 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.31 
 
 		 457 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.65 
 
 		 517 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.28 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  34.55 
 
 		 306 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.58 
 
 		 509 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  25 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>