117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3526 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  100 
 
 		 682 aa  1333    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  43.69 
 
 		 589 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  35.6 
 
 		 643 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  41.76 
 
 		 848 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  50.34 
 
 		 442 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  47.6 
 
 		 847 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.59 
 
 		 885 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  40.28 
 
 		 554 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.68 
 
 		 600 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  43.35 
 
 		 976 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.79 
 
 		 871 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.73 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.18 
 
 		 905 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  43.92 
 
 		 1192 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.33 
 
 		 684 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  43.24 
 
 		 998 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  42.26 
 
 		 1412 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  40.6 
 
 		 661 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.65 
 
 		 624 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  35.14 
 
 		 714 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  40.63 
 
 		 1037 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.14 
 
 		 656 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  39.19 
 
 		 635 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  39.32 
 
 		 678 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  35.62 
 
 		 673 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.75 
 
 		 688 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.54 
 
 		 609 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.26 
 
 		 1073 aa  138  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.57 
 
 		 706 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.93 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  34.41 
 
 		 663 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.9 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.42 
 
 		 627 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.63 
 
 		 570 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.75 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  43.82 
 
 		 635 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.27 
 
 		 860 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  30.36 
 
 		 1452 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.63 
 
 		 769 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  32.58 
 
 		 637 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  32.95 
 
 		 688 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.75 
 
 		 600 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.39 
 
 		 326 aa  104  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.63 
 
 		 543 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.11 
 
 		 719 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  36.49 
 
 		 841 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.18 
 
 		 795 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.58 
 
 		 1312 aa  98.6  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  30.18 
 
 		 640 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  32.19 
 
 		 1045 aa  97.8  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.07 
 
 		 962 aa  95.1  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  28.4 
 
 		 600 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  33.79 
 
 		 667 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.87 
 
 		 649 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.53 
 
 		 2884 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  29.51 
 
 		 538 aa  87.4  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  27.64 
 
 		 1550 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.53 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.73 
 
 		 619 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.36 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.96 
 
 		 1916 aa  73.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  27.59 
 
 		 6276 aa  63.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  27.9 
 
 		 833 aa  61.6  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  26.35 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.13 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2885  PKD domain-containing protein  31.5 
 
 		 991 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.88 
 
 		 749 aa  58.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  26.27 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  28.37 
 
 		 816 aa  52.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.16 
 
 		 623 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.71 
 
 		 1059 aa  50.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.51 
 
 		 1916 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.4 
 
 		 1565 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.1 
 
 		 1135 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  32.72 
 
 		 734 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  28.83 
 
 		 675 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  28.39 
 
 		 1882 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  37.93 
 
 		 967 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.94 
 
 		 713 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.44 
 
 		 1300 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  57.89 
 
 		 393 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.59 
 
 		 1842 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.68 
 
 		 930 aa  48.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.64 
 
 		 658 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.41 
 
 		 1606 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.82 
 
 		 475 aa  47.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.74 
 
 		 752 aa  47.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.72 
 
 		 1158 aa  47.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  27.47 
 
 		 679 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  32.16 
 
 		 816 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.93 
 
 		 551 aa  47  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  44.62 
 
 		 938 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  31.78 
 
 		 995 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.61 
 
 		 3295 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  35.15 
 
 		 1150 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  28.22 
 
 		 1120 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  30.67 
 
 		 2000 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  30.4 
 
 		 713 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  32.93 
 
 		 918 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  26.54 
 
 		 561 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>