More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3212 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2402  feruloyl-CoA synthase  60.6 
 
 		 648 aa  722    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5463  feruloyl-CoA synthase  71.19 
 
 		 630 aa  857    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.498591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3356  feruloyl-CoA synthase  61.05 
 
 		 589 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0227  feruloyl-CoA synthase  70 
 
 		 624 aa  827    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000611579  normal  0.0633289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2941  feruloyl-CoA-synthetase  61.46 
 
 		 589 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3212  feruloyl-CoA synthase  100 
 
 		 640 aa  1286    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0164593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2726  feruloyl-CoA synthase  60.73 
 
 		 633 aa  735    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0855511  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4868  feruloyl-CoA synthase  67.42 
 
 		 671 aa  835    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2363  feruloyl-CoA synthase  67.59 
 
 		 618 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0052  feruloyl-CoA synthase  71.36 
 
 		 632 aa  835    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14250  feruloyl-CoA synthase  61.98 
 
 		 626 aa  737    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150402  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5225  feruloyl-CoA synthase  70.92 
 
 		 633 aa  837    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1069  feruloyl-CoA synthase  67.59 
 
 		 618 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405771  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4595  feruloyl-CoA synthase  69.85 
 
 		 628 aa  842    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29967  hitchhiker  0.00184939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0993  feruloyl-CoA synthase  59.12 
 
 		 626 aa  697    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4403  feruloyl-CoA synthase  55.3 
 
 		 617 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4914  feruloyl-CoA synthase  71.36 
 
 		 635 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5634  feruloyl-CoA synthase  70.92 
 
 		 633 aa  837    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963317  decreased coverage  0.000306269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4024  feruloyl-CoA synthase  71.45 
 
 		 633 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2049  feruloyl-CoA synthase  61.44 
 
 		 627 aa  731    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0087834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0273  feruloyl-CoA synthase  53.07 
 
 		 619 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0855092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3112  feruloyl-CoA synthase  53.47 
 
 		 619 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0796  feruloyl-CoA synthase  51.15 
 
 		 618 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  50.67 
 
 		 606 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7092  feruloyl-CoA synthase  51.02 
 
 		 609 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3577  feruloyl-CoA synthase  50.81 
 
 		 630 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.426843  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1887  feruloyl-CoA synthase  50 
 
 		 635 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.652828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1989  feruloyl-CoA synthase  50.52 
 
 		 631 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0490282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3017  feruloyl-CoA synthase  45.32 
 
 		 617 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.144326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0753  acyl-CoA synthetase  45.53 
 
 		 618 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6831  acyl-CoA synthetase  43.92 
 
 		 643 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6949  feruloyl-CoA synthase  46.58 
 
 		 617 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2493  feruloyl-CoA synthase  45.68 
 
 		 625 aa  474  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.621616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0285  feruloyl-CoA synthase  46.9 
 
 		 611 aa  458  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1661  acyl-CoA synthetase  41.76 
 
 		 618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.911989  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3607  acyl-CoA synthetase  42.9 
 
 		 624 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.924205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3240  feruloyl-CoA synthase  41.53 
 
 		 599 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0559816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42140  feruloyl-CoA synthase  40.37 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 		 631 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.536518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7119  acyl-CoA synthetase  44.11 
 
 		 622 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.616536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0071  feruloyl-CoA synthase  43.17 
 
 		 605 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.687661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1686  acyl-CoA synthetase  42.48 
 
 		 624 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4340  acyl-CoA synthetase  38.98 
 
 		 620 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1907  acyl-CoA synthetase  41.79 
 
 		 624 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0743337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5153  acyl-CoA synthetase  41.14 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481583 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0834  putative feruloyl-CoA synthetase  70.8 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5023  feruloyl-CoA synthase  39.71 
 
 		 631 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325533  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4165  feruloyl-CoA synthase  36.32 
 
 		 627 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0463455  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2723  feruloyl-CoA synthase  35.66 
 
 		 626 aa  363  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0667  feruloyl-CoA synthase  38.42 
 
 		 573 aa  359  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.139624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4356  feruloyl-CoA synthase  37.83 
 
 		 603 aa  343  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 560 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0288288  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0835  feruloyl-CoA synthetase  62.42 
 
 		 312 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 		 633 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 609 aa  118  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  23.18 
 
 		 590 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 630 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  25.21 
 
 		 609 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  25.25 
 
 		 633 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 		 592 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 616 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 606 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 606 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  24.18 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 		 559 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  22.11 
 
 		 587 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  23.62 
 
 		 592 aa  105  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  24.54 
 
 		 663 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  24.14 
 
 		 600 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 562 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2510  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 		 1549 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2423  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 		 1549 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  24.07 
 
 		 702 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0475  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 567 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.958743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.79 
 
 		 557 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 		 607 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 620 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  25.67 
 
 		 1549 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.750359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.58 
 
 		 557 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 		 610 aa  98.2  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.89 
 
 		 557 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  23.48 
 
 		 602 aa  97.8  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1437  AMP-dependent synthetase and ligase  26.44 
 
 		 1460 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.15 
 
 		 557 aa  97.4  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.58 
 
 		 557 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  23.32 
 
 		 604 aa  97.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.37 
 
 		 557 aa  97.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.58 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  23.13 
 
 		 603 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  21.86 
 
 		 590 aa  96.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  24.13 
 
 		 612 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.34 
 
 		 557 aa  95.1  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  24.63 
 
 		 598 aa  95.1  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.06 
 
 		 610 aa  94.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  23.04 
 
 		 603 aa  94.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.9 
 
 		 557 aa  94.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.24 
 
 		 566 aa  94.4  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  22.83 
 
 		 679 aa  94  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  22.77 
 
 		 610 aa  94  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.16 
 
 		 557 aa  94  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>