89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3390 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 1246 aa  2473    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  65.92 
 
 		 618 aa  792    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  32.53 
 
 		 626 aa  278  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  31.74 
 
 		 628 aa  274  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  33.03 
 
 		 629 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  28.35 
 
 		 847 aa  226  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  29.9 
 
 		 624 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  30.36 
 
 		 843 aa  214  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  26 
 
 		 1194 aa  164  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  48.21 
 
 		 768 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  45.9 
 
 		 748 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  44.74 
 
 		 873 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  43.75 
 
 		 818 aa  97.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  40.54 
 
 		 912 aa  95.5  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  27.99 
 
 		 628 aa  94  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  45.38 
 
 		 552 aa  92.8  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  38.46 
 
 		 1422 aa  88.6  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  28.14 
 
 		 581 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  35.33 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  37.58 
 
 		 1427 aa  81.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 524 aa  81.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  39.1 
 
 		 1426 aa  77.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  24.54 
 
 		 566 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  38.18 
 
 		 1131 aa  74.7  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  39.64 
 
 		 1019 aa  73.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  23.54 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  23.27 
 
 		 645 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  21.64 
 
 		 761 aa  68.6  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  25.26 
 
 		 644 aa  66.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  23 
 
 		 649 aa  65.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  21.82 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.97 
 
 		 159 aa  64.3  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  28.97 
 
 		 159 aa  64.3  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.07 
 
 		 1158 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  39.25 
 
 		 1070 aa  63.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  28.04 
 
 		 159 aa  62.4  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  33.93 
 
 		 644 aa  62  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.29 
 
 		 477 aa  62  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.18 
 
 		 674 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  24.85 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  33.33 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  34 
 
 		 712 aa  57  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.06 
 
 		 986 aa  56.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  40.74 
 
 		 392 aa  56.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.54 
 
 		 953 aa  55.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.91 
 
 		 1321 aa  55.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.08 
 
 		 971 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.56 
 
 		 756 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.55 
 
 		 929 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.32 
 
 		 159 aa  53.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.67 
 
 		 801 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2872  Peptidase M64, IgA  30.26 
 
 		 785 aa  52.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.87 
 
 		 1362 aa  52.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.32 
 
 		 159 aa  52.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  30.28 
 
 		 449 aa  52  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  30.61 
 
 		 987 aa  52  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  27.45 
 
 		 1471 aa  52  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.15 
 
 		 639 aa  51.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  28.81 
 
 		 452 aa  51.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.67 
 
 		 755 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  23.42 
 
 		 660 aa  51.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.33 
 
 		 962 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  34.51 
 
 		 433 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  32.61 
 
 		 1103 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.68 
 
 		 1007 aa  50.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  33.02 
 
 		 752 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  33.61 
 
 		 850 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.51 
 
 		 695 aa  49.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 940 aa  48.5  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.08 
 
 		 1564 aa  48.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  24.86 
 
 		 558 aa  48.5  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.91 
 
 		 984 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  34.83 
 
 		 999 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  25.47 
 
 		 2095 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  21.11 
 
 		 598 aa  46.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  34.15 
 
 		 1439 aa  46.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  33.61 
 
 		 4013 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  25.71 
 
 		 2095 aa  46.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.87 
 
 		 1038 aa  45.8  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.86 
 
 		 1117 aa  45.8  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  25.87 
 
 		 1627 aa  45.8  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  20.58 
 
 		 601 aa  45.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3800  hypothetical protein  29.14 
 
 		 678 aa  45.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 1338 aa  45.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1017  hypothetical protein  30.56 
 
 		 506 aa  45.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.09 
 
 		 722 aa  45.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  40.98 
 
 		 1581 aa  45.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  22.03 
 
 		 597 aa  45.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  26.45 
 
 		 1061 aa  44.7  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>