24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0131 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1155    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  46.98 
 
 		 581 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  30.43 
 
 		 628 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  27.62 
 
 		 647 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  29.26 
 
 		 637 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  28.63 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  26.99 
 
 		 649 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  27.5 
 
 		 601 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  28.84 
 
 		 644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  28.05 
 
 		 597 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  26.64 
 
 		 646 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  26.65 
 
 		 649 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  29.59 
 
 		 623 aa  120  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  25.23 
 
 		 598 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  27.37 
 
 		 660 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  28.74 
 
 		 676 aa  94.7  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.21 
 
 		 1246 aa  77.4  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  23.96 
 
 		 629 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  26.53 
 
 		 618 aa  67  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  21.23 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  27.16 
 
 		 847 aa  53.5  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  20.86 
 
 		 626 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  24.83 
 
 		 624 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  20.63 
 
 		 761 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>