21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2452 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1354    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  62.75 
 
 		 646 aa  853    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  39.72 
 
 		 644 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  39.84 
 
 		 649 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  34.11 
 
 		 645 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  35.29 
 
 		 598 aa  296  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  33.96 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  33.16 
 
 		 601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  31.59 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  28.36 
 
 		 623 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  28.5 
 
 		 676 aa  233  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  29.55 
 
 		 628 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  26.95 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  26.99 
 
 		 566 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  24.53 
 
 		 647 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  24.14 
 
 		 637 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  25.26 
 
 		 618 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  23 
 
 		 1246 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  23.73 
 
 		 847 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  22.85 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  22.22 
 
 		 628 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>