17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29060 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1321    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  45.71 
 
 		 660 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  42.72 
 
 		 623 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  29.58 
 
 		 646 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  28.5 
 
 		 649 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 645 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  30.1 
 
 		 644 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  31.3 
 
 		 597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  31 
 
 		 601 aa  200  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  29.39 
 
 		 598 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  27.29 
 
 		 649 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  32.68 
 
 		 628 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  29.65 
 
 		 581 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  28.74 
 
 		 566 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  21.93 
 
 		 637 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  21.64 
 
 		 647 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  21.82 
 
 		 628 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>