23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7349 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  63.08 
 
 		 597 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1241    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  61.3 
 
 		 598 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  33.33 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  34.04 
 
 		 649 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  33.05 
 
 		 649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  33.7 
 
 		 644 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  31.65 
 
 		 645 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  29.98 
 
 		 660 aa  240  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  30.64 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  30.88 
 
 		 676 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  28.6 
 
 		 628 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  28.98 
 
 		 581 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  27.67 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  27.8 
 
 		 647 aa  98.2  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  23.11 
 
 		 637 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  21.29 
 
 		 628 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  24.15 
 
 		 618 aa  50.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  20.98 
 
 		 1246 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  20.99 
 
 		 626 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  22.69 
 
 		 624 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  33.33 
 
 		 1200 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  29.67 
 
 		 634 aa  43.9  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>