26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5054 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  81.44 
 
 		 597 aa  968    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  61.26 
 
 		 601 aa  719    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 598 aa  1219    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  33.68 
 
 		 649 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  33.77 
 
 		 646 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  33.27 
 
 		 649 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  35.5 
 
 		 645 aa  283  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  33.82 
 
 		 644 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  35.47 
 
 		 660 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  29.76 
 
 		 676 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  30.1 
 
 		 623 aa  197  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  29.96 
 
 		 628 aa  160  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  28.3 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  26.02 
 
 		 566 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  21.66 
 
 		 647 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  21.28 
 
 		 637 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  22.91 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.86 
 
 		 1246 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  22.67 
 
 		 847 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  24.86 
 
 		 624 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  24.24 
 
 		 618 aa  53.9  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  20.19 
 
 		 626 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  19.95 
 
 		 628 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  32.5 
 
 		 1200 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  32.1 
 
 		 634 aa  45.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  30.85 
 
 		 560 aa  43.9  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>