22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4959 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1333    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  44.8 
 
 		 649 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  39.72 
 
 		 649 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  38.84 
 
 		 646 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  34.41 
 
 		 645 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  32.72 
 
 		 601 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  33.96 
 
 		 597 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  33.79 
 
 		 660 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  33.09 
 
 		 598 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  32.64 
 
 		 628 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  30.97 
 
 		 623 aa  224  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  30.1 
 
 		 676 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  26.98 
 
 		 581 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  28.84 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  25.45 
 
 		 647 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  24.24 
 
 		 637 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  25.14 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.26 
 
 		 1246 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  24.67 
 
 		 761 aa  54.3  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  22.95 
 
 		 628 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  21.63 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  24.8 
 
 		 906 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>