22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1283    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  52.36 
 
 		 623 aa  558  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  45.71 
 
 		 676 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  30.74 
 
 		 646 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  31.59 
 
 		 649 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  31.39 
 
 		 649 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  33.79 
 
 		 644 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  29.12 
 
 		 645 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  34.54 
 
 		 597 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  35.47 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  30.46 
 
 		 601 aa  233  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  31.19 
 
 		 628 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  31.57 
 
 		 581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  24.31 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  24.07 
 
 		 647 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  27.37 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  24.63 
 
 		 618 aa  67.8  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  23.94 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  21.33 
 
 		 626 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  25.29 
 
 		 624 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.42 
 
 		 1246 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  22.44 
 
 		 629 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>