21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1459 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  56.89 
 
 		 628 aa  774    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  53.27 
 
 		 629 aa  658    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 626 aa  1303    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  40.34 
 
 		 847 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1194 aa  330  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.53 
 
 		 1246 aa  263  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  31.31 
 
 		 618 aa  259  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  28.36 
 
 		 624 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  28.15 
 
 		 843 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  25.95 
 
 		 628 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2894  heparinase II/III family protein  22.56 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  23.86 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  21.33 
 
 		 660 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  21.82 
 
 		 597 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  20.86 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  22.22 
 
 		 646 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  24.66 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  20.72 
 
 		 647 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  21.77 
 
 		 645 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  19.88 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  23.39 
 
 		 598 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>