24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2654 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1752    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1194 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  44.08 
 
 		 628 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  42.11 
 
 		 629 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  40.34 
 
 		 626 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  29.36 
 
 		 624 aa  235  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.35 
 
 		 1246 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  27.89 
 
 		 618 aa  214  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  27.93 
 
 		 843 aa  157  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  27.87 
 
 		 628 aa  94.7  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  23.78 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  28.14 
 
 		 647 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  23.73 
 
 		 649 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  20.83 
 
 		 597 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  27.16 
 
 		 566 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  21.1 
 
 		 646 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  20.9 
 
 		 649 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2894  heparinase II/III family protein  23.84 
 
 		 694 aa  51.2  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  21.57 
 
 		 581 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  22.07 
 
 		 598 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  23.15 
 
 		 623 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  21.72 
 
 		 761 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  22.69 
 
 		 742 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  21.96 
 
 		 645 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>