23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3947 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  100 
 
 		 624 aa  1288    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  30.14 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  29.12 
 
 		 628 aa  266  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  28.36 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  29.36 
 
 		 847 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  30.97 
 
 		 618 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.9 
 
 		 1246 aa  213  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1194 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  24.28 
 
 		 843 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  26.48 
 
 		 628 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  25.8 
 
 		 581 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  24.13 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  25.12 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  25.29 
 
 		 660 aa  53.9  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  22.85 
 
 		 649 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  24.83 
 
 		 566 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  23.6 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  20.37 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0606  Heparinase II/III family protein  26.14 
 
 		 705 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  24.44 
 
 		 597 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  22.69 
 
 		 601 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  21.22 
 
 		 722 aa  44.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  22.42 
 
 		 672 aa  43.5  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>