24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3961 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1347    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  43.73 
 
 
637 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  28.9 
 
 
628 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  27.62 
 
 
566 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  27.65 
 
 
581 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  24.03 
 
 
649 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  24.07 
 
 
660 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  25.45 
 
 
644 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  24.53 
 
 
649 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  24.4 
 
 
646 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  22.31 
 
 
597 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  26.52 
 
 
601 aa  91.3  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  22.22 
 
 
645 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  21.54 
 
 
598 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  23.02 
 
 
623 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  22.97 
 
 
618 aa  74.7  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  28.14 
 
 
847 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  21.33 
 
 
676 aa  66.6  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  24.13 
 
 
624 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.82 
 
 
1246 aa  65.1  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  22.93 
 
 
629 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  22.73 
 
 
628 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  20.72 
 
 
626 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  23.22 
 
 
1194 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>