27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5337 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
597 aa  1219    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  63.08 
 
 
601 aa  741    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  80.94 
 
 
598 aa  953    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4527  heparinase II/III family protein  33.05 
 
 
646 aa  323  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0598567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2452  hypothetical protein  34.15 
 
 
649 aa  313  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132019  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5870  Heparinase II/III family protein  34.7 
 
 
649 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  35.58 
 
 
645 aa  291  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  34.34 
 
 
644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  34.54 
 
 
660 aa  259  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  30.68 
 
 
623 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29060  hypothetical protein  31.3 
 
 
676 aa  213  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  31.08 
 
 
628 aa  181  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  28.99 
 
 
581 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  28.52 
 
 
566 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  23.08 
 
 
637 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  22.47 
 
 
647 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  22.8 
 
 
629 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  22.08 
 
 
626 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  20.65 
 
 
847 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  25.38 
 
 
618 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  21.71 
 
 
628 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.48 
 
 
1246 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  24.44 
 
 
624 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  34.09 
 
 
766 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  35.79 
 
 
1200 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  24.71 
 
 
722 aa  43.9  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  32.1 
 
 
634 aa  43.5  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>