18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0256 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3284  hypothetical protein  48.54 
 
 		 736 aa  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.924939  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3104  heparinase II/III family protein  46.14 
 
 		 760 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0256  heparinase II/III family protein  100 
 
 		 722 aa  1469    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.627284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46500  alginate lyase  51.3 
 
 		 742 aa  686    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2067  Heparinase II/III family protein  48.08 
 
 		 744 aa  673    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.720952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3651  heparinase II/III-like  41.11 
 
 		 748 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11508  putative chondroitin AC/alginate lyase  40.03 
 
 		 759 aa  557  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0906796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1166  Heparinase II/III family protein  41.24 
 
 		 741 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.307073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4014  hypothetical protein  27.97 
 
 		 672 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3711  heparinase II/III family protein  27.97 
 
 		 672 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3577  heparinase II/III-like family protein  27.97 
 
 		 672 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0489  heparinase II/III family protein  22.47 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3334  Heparinase II/III family protein  29.87 
 
 		 1064 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.503673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0331  Heparinase II/III family protein  22.05 
 
 		 1005 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2409  Heparinase II/III family protein  23 
 
 		 818 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3344  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1064 aa  46.6  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  31.82 
 
 		 968 aa  45.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  21.22 
 
 		 624 aa  44.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>