19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1390 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
1200 aa  2368    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2429  hypothetical protein  36.34 
 
 
1089 aa  201  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2514  VanZ like protein  37.04 
 
 
1119 aa  200  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2408  Heparinase II/III family protein  27.01 
 
 
772 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0504135  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0107  VanZ family protein  30.24 
 
 
1122 aa  131  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1547  VanZ family protein  32.74 
 
 
1131 aa  127  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0606  Heparinase II/III family protein  25.58 
 
 
705 aa  118  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0208  hypothetical protein  31.19 
 
 
773 aa  112  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2345  VanZ family protein  31.07 
 
 
444 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2545  VanZ family protein  31.15 
 
 
487 aa  97.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29551  normal  0.0372362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  23.27 
 
 
761 aa  68.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1999  hypothetical protein  25.05 
 
 
948 aa  57.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  25.95 
 
 
629 aa  55.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2313  hypothetical protein  22.89 
 
 
814 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.862901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  21.33 
 
 
1194 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  23.28 
 
 
628 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  35.79 
 
 
597 aa  45.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  33.03 
 
 
598 aa  45.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7349  hypothetical protein  33.33 
 
 
601 aa  45.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>